El rio Urola nace en las faldas del macizo Aizkorri y tras recorrer 60 km desemboca en Zumaia. En Oikia las aguas dulces del río se mezclan con las aguas saladas del mar y el río se convierte en estuario. Las abundantes terrazas aluviales y  los grandes meandros conforman un paisaje diverso. El estuario del Urola es hoy en día una zona protegida por la Unión Europea dentro de la Red Natura 2000 y tiene una extensión de 102 hectáreas.

La marisma es un ecosistema de bajo relieve situado en la desembocadura del río. En esas depresiones se ralentiza la velocidad de las corrientes de agua y se acumulan limos, y en  consecuencia, se forman zonas pantanosas. La marisma suele ser un ecosistema cambiante que varía continuamente bajo la influencia del vaivén de las mareas y los caudales de los ríos, pudiendo diferenciarse nichos ecológicos de gran diversidad. La marisma de Bedua es un área de descanso muy importante para las aves migratorias.

Las dunas de la playa de Santiago son las más extensas de Gipuzkoa. Las dunas crean ecosistemas altamente vulnerables y dinámicos, debido a sus especiales características (tierra movediza, alta salinidad, falta de agua dulce, etc.), influencia que se refleja en la aparición de comunidades de flora y fauna de gran interés que se han adaptado a las condiciones más difíciles. De ahí la gran cantidad de vegetación especializada que habita en el lugar. En este hábitat también se pueden apreciar orquídeas espectaculares, algunas de las cuales son únicas.